Nezha, nacido de una perla celestial con poderes únicos, pronto se encontrará exiliado, odiado y temido por la gente que cree en una profecía que indica que él traerá la destrucción del mundo. Llegará el momento en el que deberá decidir entre el bien y el mal con el propósito de romper los grilletes del destino y convertirse en un héroe. Película inspirada muy libremente en «Fengshen Yanyi» («La Investidura de los Dioses»), una de las grandes novelas chinas escritas en la Dinastía Ming cuya autoría se atribuye a Xu Zhonglin o Lu Xixing.
Leo San Juan, a un año de haber derrotado al espíritu de La Nahuala, se enfrenta ahora a su primera gran misión: liberar a Xochimilco de La Llorona, el espíritu de una mujer que durante cientos de años ha asolado a la comunidad y ha secuestrado a decenas de niños. Con la ayuda de El Alebrije, Don Andrés y los niños Calaca, Leo planea vencerla. Sin embargo, el poder de ella hará que nuestro héroe y sus aliados se separen, enfrentando cada quien por su lado los peligros que aparecen en un Xochimilco embrujado por las lágrimas de La Llorona y las fuerzas obscuras que, desde la antigüedad, acechan detrás de este terrible monstruo.